Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJQ7

SCP2D1, SCP2 sterol-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2D1Q9UJQ7 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SCP2D1Q9UJQ7 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SCP2D1Q9UJQ7 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms