Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW2

PLXNA1, Plexin-A1, humanhuman

Predictions only

Length 1,896 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA1Q9UIW2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PLXNA1Q9UIW2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
PLXNA1Q9UIW2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PLXNA1Q9UIW2 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms