Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH36

SRRD, SRR1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRDQ9UH36 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SRRDQ9UH36 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SRRDQ9UH36 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SRRDQ9UH36 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SRRDQ9UH36 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms