Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ0

DNAJC27, DnaJ homolog subfamily C member 27, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC27Q9NZQ0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
DNAJC27Q9NZQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC27Q9NZQ0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms