Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
APOBEC3GQ9HC16 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
APOBEC3GQ9HC16 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
APOBEC3GQ9HC16 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms