Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8W5

TRIM45, Tripartite motif-containing protein 45, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM45Q9H8W5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRIM45Q9H8W5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TRIM45Q9H8W5 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM45Q9H8W5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TRIM45Q9H8W5 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM45Q9H8W5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM45Q9H8W5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM45Q9H8W5 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TRIM45Q9H8W5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TRIM45Q9H8W5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms