Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 60 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SMIM3Q9BZL3 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SMIM3Q9BZL3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms