Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD1

SHANK2-AS3, Putative uncharacterized protein SHANK2-AS3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2-AS3Q9BTD1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SHANK2-AS3Q9BTD1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms