Protein–RNA interactions for Protein: Q99967

CITED2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2Q99967 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CITED2Q99967 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CITED2Q99967 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CITED2Q99967 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 392.1 ms