Protein–RNA interactions for Protein: Q99797

MIPEP, Mitochondrial intermediate peptidase, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIPEPQ99797 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPEPQ99797 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPEPQ99797 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPEPQ99797 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPEPQ99797 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPEPQ99797 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPEPQ99797 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPEPQ99797 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MIPEPQ99797 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MIPEPQ99797 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MIPEPQ99797 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MIPEPQ99797 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPEPQ99797 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MIPEPQ99797 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms