Protein–RNA interactions for Protein: Q96S86

HAPLN3, Hyaluronan and proteoglycan link protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN3Q96S86 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HAPLN3Q96S86 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HAPLN3Q96S86 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HAPLN3Q96S86 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms