Protein–RNA interactions for Protein: Q96NZ9

PRAP1, Proline-rich acidic protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAP1Q96NZ9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRAP1Q96NZ9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRAP1Q96NZ9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRAP1Q96NZ9 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms