Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF558Q96NG5 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF558Q96NG5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF558Q96NG5 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.8 ms