Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CNBD2Q96M20 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CNBD2Q96M20 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNBD2Q96M20 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms