Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT9

RNPC3, RNA-binding protein 40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNPC3Q96LT9 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
RNPC3Q96LT9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
RNPC3Q96LT9 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RNPC3Q96LT9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RNPC3Q96LT9 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
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