Protein–RNA interactions for Protein: Q96JE7

SEC16B, Protein transport protein Sec16B, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC16BQ96JE7 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SEC16BQ96JE7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SEC16BQ96JE7 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SEC16BQ96JE7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SEC16BQ96JE7 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms