Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.56■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
BCANQ96GW7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.49■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
BCANQ96GW7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
BCANQ96GW7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
BCANQ96GW7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.1 ms