Protein–RNA interactions for Protein: Q96DD0

LRRC39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC39Q96DD0 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC39Q96DD0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC39Q96DD0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC39Q96DD0 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms