Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KCTD12Q96CX2 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KCTD12Q96CX2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
KCTD12Q96CX2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms