Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TSKUQ8WUA8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TSKUQ8WUA8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TSKUQ8WUA8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSKUQ8WUA8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TSKUQ8WUA8 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms