Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MCOLN3Q8TDD5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
MCOLN3Q8TDD5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MCOLN3Q8TDD5 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms