Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEN9

PDZD8, PDZ domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD8Q8NEN9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PDZD8Q8NEN9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PDZD8Q8NEN9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PDZD8Q8NEN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
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