Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7F7

UBL4B, Ubiquitin-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL4BQ8N7F7 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
UBL4BQ8N7F7 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UBL4BQ8N7F7 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBL4BQ8N7F7 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.8 ms