Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
ARHGEF28Q8N1W1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARHGEF28Q8N1W1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARHGEF28Q8N1W1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
ARHGEF28Q8N1W1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
ARHGEF28Q8N1W1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
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