Protein–RNA interactions for Protein: Q86YR7

MCF2L2, Probable guanine nucleotide exchange factor MCF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2L2Q86YR7 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MCF2L2Q86YR7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MCF2L2Q86YR7 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MCF2L2Q86YR7 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MCF2L2Q86YR7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms