Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCDC137Q6PK04 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCDC137Q6PK04 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms