Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
C9orf135Q5VTT2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
C9orf135Q5VTT2 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
C9orf135Q5VTT2 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.6 ms