Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
LINC01545Q5VT33 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
LINC01545Q5VT33 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LINC01545Q5VT33 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms