Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6M2

LINC00242, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00242, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00242Q5T6M2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LINC00242Q5T6M2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
LINC00242Q5T6M2 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms