Protein–RNA interactions for Protein: Q5GJ75

TNFAIP8L3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP8L3Q5GJ75 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNFAIP8L3Q5GJ75 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TNFAIP8L3Q5GJ75 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TNFAIP8L3Q5GJ75 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms