Protein–RNA interactions for Protein: Q53TQ3

INO80D, INO80 complex subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80DQ53TQ3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
INO80DQ53TQ3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80DQ53TQ3 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80DQ53TQ3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms