Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C4orf17Q53FE4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.3■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.29■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
C4orf17Q53FE4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C4orf17Q53FE4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms