Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CTF1Q16619 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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CTF1Q16619 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CTF1Q16619 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CTF1Q16619 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CTF1Q16619 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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CTF1Q16619 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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CTF1Q16619 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CTF1Q16619 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
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