Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NEDD8Q15843 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NEDD8Q15843 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
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