Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.98■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
ITSN1Q15811 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC32.9■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
ITSN1Q15811 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.85■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.82■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
ITSN1Q15811 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.79■■■□□ 2.84
ITSN1Q15811 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
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