Protein–RNA interactions for Protein: Q15527

SURF2, Surfeit locus protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF2Q15527 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
SURF2Q15527 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
SURF2Q15527 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms