Protein–RNA interactions for Protein: Q13884

SNTB1, Beta-1-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB1Q13884 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNTB1Q13884 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SNTB1Q13884 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
SNTB1Q13884 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms