Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RBBP4Q09028 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RBBP4Q09028 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RBBP4Q09028 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms