Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PAX8Q06710 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
PAX8Q06710 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PAX8Q06710 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms