Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CTDSPL2Q05D32 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CTDSPL2Q05D32 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CTDSPL2Q05D32 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CTDSPL2Q05D32 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms