Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARID5AQ03989 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
ARID5AQ03989 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ARID5AQ03989 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ARID5AQ03989 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms