Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PPARDQ03181 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPARDQ03181 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPARDQ03181 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms