Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
BEX3Q00994 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
BEX3Q00994 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEX3Q00994 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
BEX3Q00994 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BEX3Q00994 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
BEX3Q00994 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
BEX3Q00994 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
BEX3Q00994 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
BEX3Q00994 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms