Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FANCCQ00597 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
FANCCQ00597 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
FANCCQ00597 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms