Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	GDA1	YEL042W	1557 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	SEC12	YNR026C	1416 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	ATO3	YDR384C	828 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	YLR157W-E	YLR157W-E	165 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	YML018C	YML018C	1182 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	RBD2	YPL246C	789 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	MNN2	YBR015C	1794 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	YEL077C	YEL077C	3834 nt		3.73	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	RET1	YOR207C	3450 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	CLP1	YOR250C	1338 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	YNL097W-A	YNL097W-A	156 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	AMD1	YML035C	2433 nt		3.72	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	VTC2	YFL004W	2487 nt		3.71	□□□□□ -1.81
DDR2	P89113	ROG3	YFR022W	2202 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YEL075W-A	YEL075W-A	612 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	BUD32	YGR262C	786 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	SFC1	YJR095W	969 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	SRY1	YKL218C	981 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YLR463C	YLR463C	552 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	ERI1	YPL096C-A	207 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YPR098C	YPR098C	486 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	ISN1	YOR155C	1353 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	UTP18	YJL069C	1785 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	BUL1	YMR275C	2931 nt		3.71	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	BAP2	YBR068C	1830 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YAP1801	YHR161C	1914 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	UGX2	YDL169C	672 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YEA6	YEL006W	1008 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	APS3	YJL024C	585 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YJL193W	YJL193W	1209 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	PGA2	YNL149C	390 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YBR124W	YBR124W	360 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	RFA1	YAR007C	1866 nt		3.7	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	DBP9	YLR276C	1785 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	SEC20	YDR498C	1152 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	CDC43	YGL155W	1131 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	DOT5	YIL010W	648 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	RPS15	YOL040C	429 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	SCT1	YBL011W	2280 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	HPF1	YOL155C	2904 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	SIA1	YOR137C	1869 nt		3.69	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	PKC1	YBL105C	3456 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YCL065W	YCL065W	369 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	MDH3	YDL078C	1032 nt		3.68	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	TRP1	YDR007W	675 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	FYV1	YDR024W	486 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YDR053W	YDR053W	396 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	GLO2	YDR272W	825 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	MRF1	YGL143C	1242 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	AAD15	YOL165C	432 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	CSG2	YBR036C	1233 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	MRP51	YPL118W	1035 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	ASF2	YDL197C	1578 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	TRK2	YKR050W	2670 nt		3.67	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	PRP46	YPL151C	1356 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YDL114W	YDL114W	927 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YRA1	YDR381W	681 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	PRS1	YKL181W	1284 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	YKR041W	YKR041W	753 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	IDP3	YNL009W	1263 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	PIF1	YML061C	2580 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	RPT4	YOR259C	1314 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	ABZ1	YNR033W	2364 nt		3.66	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	UTP7	YER082C	1665 nt		3.65	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	UGO1	YDR470C	1509 nt		3.65	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	TEF1	YPR080W	1377 nt		3.65	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	TEF2	YBR118W	1377 nt		3.65	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	SSK22	YCR073C	3996 nt		3.65	□□□□□ -1.82
DDR2	P89113	GEP5	YLR091W	882 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	ZRT2	YLR130C	1269 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	ATG12	YBR217W	561 nt		3.65	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	SSZ1	YHR064C	1617 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	YDR541C	YDR541C	1035 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	SPG1	YGR236C	288 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	YML101C-A	YML101C-A	318 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	MTQ1	YNL063W	945 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	DAL7	YIR031C	1665 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	HIS7	YBR248C	1659 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	MRK1	YDL079C	1506 nt		3.64	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	COR1	YBL045C	1374 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	PDH1	YPR002W	1551 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	STE13	YOR219C	2796 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	YFL034W	YFL034W	3222 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	PDC1	YLR044C	1692 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	SIP5	YMR140W	1470 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	HFI1	YPL254W	1467 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	ACF2	YLR144C	2340 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	MTQ2	YDR140W	666 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	RRP4	YHR069C	1080 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	MOG1	YJR074W	657 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	UBX2	YML013W	1755 nt		3.63	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	SMF3	YLR034C	1422 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	MKK1	YOR231W	1527 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	YBL044W	YBL044W	369 nt		3.62	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	RGT1	YKL038W	3513 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	YDL022C-A	YDL022C-A	249 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	VMA16	YHR026W	642 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	PAN6	YIL145C	930 nt		3.61	□□□□□ -1.83
DDR2	P89113	HXT3	YDR345C	1704 nt		3.61	□□□□□ -1.83

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