Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF6P62330 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF6P62330 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF6P62330 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARF6P62330 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF6P62330 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF6P62330 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF6P62330 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARF6P62330 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARF6P62330 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARF6P62330 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARF6P62330 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARF6P62330 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARF6P62330 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARF6P62330 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARF6P62330 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARF6P62330 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARF6P62330 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ARF6P62330 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARF6P62330 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARF6P62330 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARF6P62330 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARF6P62330 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARF6P62330 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARF6P62330 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ARF6P62330 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARF6P62330 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARF6P62330 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARF6P62330 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARF6P62330 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARF6P62330 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ARF6P62330 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARF6P62330 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARF6P62330 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ARF6P62330 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARF6P62330 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARF6P62330 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARF6P62330 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARF6P62330 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARF6P62330 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARF6P62330 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARF6P62330 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARF6P62330 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARF6P62330 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARF6P62330 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARF6P62330 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARF6P62330 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARF6P62330 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARF6P62330 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ARF6P62330 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARF6P62330 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARF6P62330 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARF6P62330 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARF6P62330 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARF6P62330 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARF6P62330 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARF6P62330 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ARF6P62330 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms