Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFM1P61960 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFM1P61960 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFM1P61960 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFM1P61960 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFM1P61960 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFM1P61960 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFM1P61960 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFM1P61960 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFM1P61960 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFM1P61960 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFM1P61960 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFM1P61960 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFM1P61960 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
UFM1P61960 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFM1P61960 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFM1P61960 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFM1P61960 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFM1P61960 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFM1P61960 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFM1P61960 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFM1P61960 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFM1P61960 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFM1P61960 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFM1P61960 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFM1P61960 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFM1P61960 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UFM1P61960 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFM1P61960 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFM1P61960 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFM1P61960 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFM1P61960 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UFM1P61960 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFM1P61960 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UFM1P61960 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UFM1P61960 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFM1P61960 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFM1P61960 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFM1P61960 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFM1P61960 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFM1P61960 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFM1P61960 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFM1P61960 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFM1P61960 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFM1P61960 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFM1P61960 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFM1P61960 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFM1P61960 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UFM1P61960 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UFM1P61960 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFM1P61960 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFM1P61960 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
UFM1P61960 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFM1P61960 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFM1P61960 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFM1P61960 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFM1P61960 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFM1P61960 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFM1P61960 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFM1P61960 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFM1P61960 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFM1P61960 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFM1P61960 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFM1P61960 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFM1P61960 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFM1P61960 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFM1P61960 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFM1P61960 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms