Protein–RNA interactions for Protein: P55042

RRAD, GTP-binding protein RAD, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRADP55042 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRADP55042 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRADP55042 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRADP55042 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RRADP55042 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RRADP55042 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRADP55042 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRADP55042 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRADP55042 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RRADP55042 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRADP55042 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RRADP55042 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRADP55042 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRADP55042 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RRADP55042 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRADP55042 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRADP55042 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
RRADP55042 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RRADP55042 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRADP55042 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RRADP55042 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRADP55042 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRADP55042 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRADP55042 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRADP55042 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRADP55042 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRADP55042 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRADP55042 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RRADP55042 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RRADP55042 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRADP55042 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RRADP55042 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRADP55042 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRADP55042 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRADP55042 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRADP55042 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRADP55042 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RRADP55042 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRADP55042 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRADP55042 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRADP55042 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRADP55042 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRADP55042 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRADP55042 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRADP55042 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRADP55042 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRADP55042 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRADP55042 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRADP55042 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRADP55042 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRADP55042 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRADP55042 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRADP55042 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRADP55042 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRADP55042 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRADP55042 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRADP55042 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRADP55042 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRADP55042 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRADP55042 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRADP55042 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRADP55042 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRADP55042 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRADP55042 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRADP55042 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRADP55042 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RRADP55042 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRADP55042 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRADP55042 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRADP55042 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRADP55042 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRADP55042 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRADP55042 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RRADP55042 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRADP55042 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRADP55042 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRADP55042 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRADP55042 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RRADP55042 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RRADP55042 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RRADP55042 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms