Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SEC24CP53992 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SEC24CP53992 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SEC24CP53992 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms