Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
DCCP43146 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DCCP43146 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DCCP43146 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
DCCP43146 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
DCCP43146 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DCCP43146 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DCCP43146 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DCCP43146 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
DCCP43146 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DCCP43146 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DCCP43146 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
DCCP43146 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
DCCP43146 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
DCCP43146 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DCCP43146 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DCCP43146 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DCCP43146 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DCCP43146 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
DCCP43146 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DCCP43146 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DCCP43146 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DCCP43146 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
DCCP43146 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
DCCP43146 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
DCCP43146 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DCCP43146 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DCCP43146 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
DCCP43146 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DCCP43146 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DCCP43146 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DCCP43146 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
DCCP43146 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DCCP43146 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
DCCP43146 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
DCCP43146 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DCCP43146 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DCCP43146 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
DCCP43146 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
DCCP43146 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DCCP43146 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
DCCP43146 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
DCCP43146 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
DCCP43146 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
DCCP43146 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
DCCP43146 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.2■■■□□ 2.9
DCCP43146 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
DCCP43146 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DCCP43146 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DCCP43146 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
DCCP43146 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DCCP43146 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
DCCP43146 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DCCP43146 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
DCCP43146 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
DCCP43146 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
DCCP43146 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DCCP43146 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
DCCP43146 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DCCP43146 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.16■■■□□ 2.9
DCCP43146 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
DCCP43146 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
DCCP43146 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
DCCP43146 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
DCCP43146 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DCCP43146 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
DCCP43146 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.89
DCCP43146 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DCCP43146 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
DCCP43146 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DCCP43146 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DCCP43146 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DCCP43146 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
DCCP43146 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DCCP43146 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
DCCP43146 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
DCCP43146 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
DCCP43146 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DCCP43146 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DCCP43146 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
DCCP43146 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
DCCP43146 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
DCCP43146 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
DCCP43146 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
DCCP43146 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
DCCP43146 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
DCCP43146 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DCCP43146 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
DCCP43146 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
DCCP43146 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
DCCP43146 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms